Общая характеристика
Экзом — это часть генома, содержащая примерно 180 тысяч экзонов. Экзон это последовательность ДНК, которая кодирует синтезируемый белок. В результате мутаций нарушается работа определенных белков или ферментов и у человека может развиться то или иное заболевание.
Экзом составляет около 1% всего генома человека и при этом содержит порядка 85% идентифицированных генетических вариантов, вызывающих заболевание, так как большинство генетических нарушений связаны именно с регионами ДНК, кодирующими белки.
Клиническая значимость
Секвенирование экзома — это исследование, позволяющее расшифровать последовательность генов, кодирующих белки и выявить патогенные (опасные) генетические варианты. Основным в секвенировании является выявление мутаций или патогенных генетических вариантов, например замена аминокислот в цепи, выпадение нескольких звеньев из последовательности или их удвоение.
По результатам полноэкзомного секвенирования пробанта рекомендовано проводить генотипирование выявленных вариантов у родителей, для определения цис- или транс-расположенных вариантов чтобы узнать унаследованные они или возникли в результате мутации de novo (впервые). В подавляющем большинстве такая тактика позволяет подтвердить диагноз или указать в каком направлении нужно двигаться дальше и целесообразно ли рассматривать секвенирование всего генома.
Количество пациентов, которым устанавливают диагноз после полного анализа экзома по разным данным, составляет от 25% до 50%. Проведение анализов отдельных мутаций или панельное тестирование реже приводит к быстрой постановке диагноза.
Показания для назначения
По рекомендациям Американского колледжа медицинской генетики и геномики (American College of Medical Genetics and Genomics) секвенирование экзома назначают:
- пациентам с подозрением на редкие моногенные заболевания для уточнения диагноза;
- пациентам с недостатками развития, когнитивными и интеллектуальными недостатками как тест первой линии;
- если врач подозревает генетическое заболевание, но болезнь невозможно распознать только по фенотипу пациента;
- если болезнь не диагностирована после многочисленных панельных ДНК тестов;
- если необходимые данные для установления диагноза не охватываются одной или несколькими панелями генетических тестов;
- при необходимости выявления статуса носителя мутации перед запланированной беременностью.
Материал для исследования
Букальный эпителий в специальном контейнере или кровь ЭДТА на специальном фильтре.
Правила подготовки пациента
- Кровь ЭДТА
Забор биологического материала производится независимо от приема пищи или лекарственных препаратов. Важным условием обеспечения достоверности результатов является отсутствие переливаний крови или ее компонентов пациенту в течении последних 2х месяцев.
- Букальный эпителий
За пол часа до забора биологического материала не есть, не пить, не жевать жевательную резинку, не курить.
