Загальна характеристика
Екзом — це частина генома, що містить приблизно 180 тисяч екзонів. Екзон це послідовність ДНК, яка кодує білок, що синтезується. В результаті мутацій порушується робота певних білків або ферментів і у людини може розвинутись те чи інше захворювання.
Екзом становить близько 1% всього генома людини і при цьому містить біля 85% ідентифікованих генетичних варіантів, що викликають захворювання, бо більшість генетичних порушень пов'язані саме з регіонами ДНК, що кодують білки.
Клінічна значущість
Секвенування екзому — це дослідження, яке дозволяє розшифрувати послідовність генів, що кодують білки та виявити патогенні (небезпечні) генетичні варіанти. Основним у секвенуванні є виявлення мутацій або патогенних генетичних варіантів, наприклад, заміна амінокислот у ланцюзі, випадання декількох ланок з послідовності або їх подвоєння.
За результатами повноекзомного секвенування пробанта рекомендовано проводити генотипування виявлених варіантів у батьків, для визначення цис- чи транс-розташованих варіантів щоб дізнатися успадковані вони чи виникли внаслідок мутації de novo (вперше). В переважній більшості така тактика дозволяє підтвердити діагноз чи вказати в якому напрямку потрібно рухатися далі та чи доцільно розглядати секвенування всього генома.
Кількість пацієнтів, яким встановлюють діагноз після повного аналізу екзому за різними даними складає від 25% до 50%. Проведення аналізів окремих мутацій чи панельне тестування рідше приводить до швидкої постановки діагнозу.
Показання для призначення
Згідно рекомендацій Американського коледжу медичної генетики та геноміки (American College of Medical Genetics and Genomics) секвенування екзому призначають:
- пацієнтам з підозрою на рідкісні моногенні захворювання для уточнення діагнозу;
- пацієнтам з вадами розвитку, когнітивними та інтелектуальними вадами як тест першої лінії;
- якщо лікар підозрює генетичне захворювання, але хворобу неможливо розпізнати лише за фенотипом пацієнта;
- якщо хворобу не діагностовано після численних панельних ДНК тестів;
- якщо необхідні дані для встановлення діагнозу не охоплюються однією чи навіть кількома панелями генетичних тестів;
- у разі необхідності виявлення статусу носійства мутації перед запланованою вагітністю.
Матеріал для дослідження
Букальний епітелій в спеціальному контейнері або кров ЕДТА на спеціальному фільтрі.
Правила підготовки пацієнта
- Кров ЕДТА
Забір біологічного матеріалу проводиться незалежно від прийому їжі чи лікарських препаратів. Важливою умовою забезпечення достовірності результатів є відсутність переливань крові чи її компонентів пацієнту протягом останніх 2х місяців.
- Букальний епітелій
За пів години до забору біологічного матеріалу не їсти, не пити, не жувати жувальну гумку, не палити.
